Pocházel ze skotské kalvínské rodiny; jeho otec byl dvorním úředníkem Marie Stuartovny. Jan navštěvoval mnoho vynikajících škol, mezi jinými v Řezně. V 17 letech se obrátil na katolickou víru. Stal se žákem papežského semináře v Olomouci a nakonec r. 1599 vstoupil k jezuitům. Noviciát absolvoval v Brně a pak žil v Rakousku. Roku 1610 přijal v Paříži kněžské svěcení a za rok poté spatřil opět svou vlast. Přicestoval tajně do Skotska, bydlel v Edinburgu v domě jednoho advokáta a vyučoval jeho syna. Kromě toho ale hojně navštěvoval uvězněné katolíky v žalářích. V roce 1614 byl Jan prozrazen a z podnětu protestantského arcibiskupa zatčen. Odvážný katolík znovu a znovu odmítal přísežně se zříci své víry, a proto byl ve vězení krutě mučen. Chtěli tím dosáhnout, aby oznámil jména dalších katolíků. On však mlčel. Ve vězení se Janovi podařilo sepsat a nakonec i propašovat ven otřesný spis o svém zatčení a mučení. Pro svou neústupnost byl nakonec za velezradu odsouzen k smrti oběšením. Rozsudek byl vykonán 10. března 1615 v Glasgowě. Je patronem Skotska.